172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13140 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  100 
 
 		 306 aa  610  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0539  type II secretion system protein  46 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  45.07 
 
 		 204 aa  125  7e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20330  Flp pilus assembly protein TadC  41.26 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400927  normal  0.182713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  31.08 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  30.11 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  25.53 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  25.47 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4481  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0728  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.552842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3964  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  23.37 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4193  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2794  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  31.2 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.637104  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  27.33 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26 
 
 		 643 aa  59.3  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  26.22 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  23.7 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3357  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0602  type II secretion system protein  23.86 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0897257  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  22.62 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1779  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708691  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  27.31 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  28 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7036  putative pilus assembly protein  26.67 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2379  type II secretion system protein  23.3 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306938  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1657  type II secretion system protein  31.2 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.374218 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2823  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4362  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4252  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal  0.358405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  25.69 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  23.81 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  26.85 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  26.51 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  25.21 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  22.82 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  27.7 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  25.48 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3796  type II secretion system protein  22.47 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.472243  normal  0.57339 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  25.33 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4449  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  26.14 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4665  Flp pilus assembly protein TadC  25.58 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502777  decreased coverage  0.000679832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  24.83 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  30.19 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1045  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1407  type II secretion system protein  25 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1525  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0311  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1501  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000870782 
 
 
-
 
NC_003296  RS02590  putative tight adherence TadC related transmembrane protein  26.38 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  26.32 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2538  hypothetical protein  26.4 
 
 		 373 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  22.11 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  25.87 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>