271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0809 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  309  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0485  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  34.59 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  36.75 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  33.88 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9046  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 204 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3332  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135407  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  27.66 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  36.28 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  30.58 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.59 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  34.55 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.19 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3813  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23740  transcriptional regulator  31.01 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10950  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  37.5 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37340  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.186615 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2098  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0688139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1701  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000687846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.88 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.88 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  30.93 
 
 		 180 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 146 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0743  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.841359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>