More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2732 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 207 aa  138  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 212 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  31.74 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36.54 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 244 aa  78.2  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.7 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  30.77 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3636  putative transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.07 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  24.68 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.38 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  26.06 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
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NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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