More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3808 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 427 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  58.27 
 
 		 424 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  58.57 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.64 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  35.98 
 
 		 426 aa  260  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  35.37 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  34.88 
 
 		 424 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 449 aa  243  5e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  33.02 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.71 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  30.52 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 422 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 449 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.9 
 
 		 431 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 483 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.3 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.42 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.67 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  33.53 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  27.52 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.8 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.66 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.73 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.39 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.89 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.88 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.56 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.21 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.6 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2274  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.44 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  24.76 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.94 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>