101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3673 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 407 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  31.89 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.24 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  30.04 
 
 		 404 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  31.06 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.59 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  30.83 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  28.78 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  30.08 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.44 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0877  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.18 
 
 		 386 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.993359 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  21.64 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  27.8 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0202  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.78 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.28 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06054  hypothetical protein  24.89 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.58 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.08 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0010  hypothetical protein  19.78 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00788782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  24.92 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  26.09 
 
 		 575 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4094  biotin carboxylase-like protein  28.25 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.138669  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.23 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.15 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.51 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  26.35 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.53 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.31 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.67 
 
 		 914 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  26.75 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2607  hypothetical protein  26.24 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.67 
 
 		 900 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  25.48 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  22.19 
 
 		 410 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.45 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1915  hypothetical protein  22.12 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0975  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.06 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.18 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.35 
 
 		 441 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  21.33 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2328  hypothetical protein  26.05 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.25 
 
 		 900 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.14 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0320  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.03 
 
 		 1078 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000336143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1457  hypothetical protein  22.6 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.939415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0906  biotin carboxylase-like protein  27.71 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.17944  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  22.97 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  21.38 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.5 
 
 		 415 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0729  D-alanyl-alanine synthetase A  31.36 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.15 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  21.78 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.4 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.83 
 
 		 726 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  28.72 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.84 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1491  hypothetical protein  23.33 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.3 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  22.22 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  22.96 
 
 		 349 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.37 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0749454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  21.19 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1742  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.9 
 
 		 385 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0814  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.16 
 
 		 1084 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.253705  normal  0.0427985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1475  hypothetical protein  20.95 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3022  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.72 
 
 		 391 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.289298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0789  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.76 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0639  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.76 
 
 		 1079 aa  46.6  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  26.27 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.22 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.33 
 
 		 1066 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13230  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.9 
 
 		 1093 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.94923  normal  0.975818 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24.71 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  25 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  26.07 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.99 
 
 		 1099 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.97 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  26.9 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.48 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.64 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0829  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.76 
 
 		 1112 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.74 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2557  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.47 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  26.74 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.54 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  24.32 
 
 		 403 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2314  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  28.36 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.08 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  26.63 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1999  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.68 
 
 		 1109 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000570089 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0008  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.94 
 
 		 1080 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4380  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  27.31 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.46 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  25.24 
 
 		 887 aa  43.1  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  24.36 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  28.3 
 
 		 1060 aa  42.7  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>