255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0200 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  832    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.1 
 
 		 756 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24.87 
 
 		 914 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24.87 
 
 		 900 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.87 
 
 		 900 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.65 
 
 		 924 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.65 
 
 		 894 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.48 
 
 		 896 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  26.2 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.48 
 
 		 926 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 912 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.16 
 
 		 904 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.16 
 
 		 904 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.97 
 
 		 891 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.54 
 
 		 411 aa  96.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  24.46 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  30.32 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  30.32 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  28.69 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.15 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.92 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.32 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  21.31 
 
 		 405 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.41 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.1 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.5 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.08 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  31.36 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.23 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.7 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  21.59 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.64 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  25.78 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.45 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.57 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  25.94 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.4 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.45 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  24.42 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  21.96 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  23.87 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  28.21 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.91 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  25.19 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  27.47 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  24.63 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.07 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.21 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  25.51 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.63 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  23.6 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.17 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.19 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  22.33 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.7 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  23.58 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.36 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.96 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  24.45 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  21.14 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  24.44 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  24.11 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  21.11 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.59 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.44 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  24.44 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.31 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  22.63 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  24.13 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.75 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  28.96 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 726 aa  56.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  26.79 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  25.42 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  23.19 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1370  D-alanyl-alanine synthetase A  22.89 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.675036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  26.72 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1147  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.54 
 
 		 1089 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  23.49 
 
 		 543 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  22.86 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2617  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.66 
 
 		 1082 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294532  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  21.83 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  21.83 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  28.19 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1775  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.54 
 
 		 1080 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  21.99 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1458  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.2 
 
 		 1083 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2390  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.2 
 
 		 1053 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4723  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.49 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4724  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.49 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4589  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.49 
 
 		 1055 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.387511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0709  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.49 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  21.11 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4191  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.89 
 
 		 1073 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.725714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.15 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.15 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>