74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3136 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  100 
 
 		 388 aa  787    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  54.41 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  53.42 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  52.04 
 
 		 399 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  45.78 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  46.46 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  46.48 
 
 		 402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  44.31 
 
 		 411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  39.65 
 
 		 401 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  38.31 
 
 		 402 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  38.38 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.43 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.43 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.43 
 
 		 914 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  24.1 
 
 		 891 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.8 
 
 		 924 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.65 
 
 		 926 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  24.71 
 
 		 894 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  24.71 
 
 		 904 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  24.71 
 
 		 896 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  23.44 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  26.84 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  24.71 
 
 		 912 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  24.71 
 
 		 904 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.77 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.81 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.81 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  26.83 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.6 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.72 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.5 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  30.48 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  24.78 
 
 		 756 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  23.36 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.68 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  25.49 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.18 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  25.97 
 
 		 441 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.31 
 
 		 543 aa  53.9  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  25.23 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  24.51 
 
 		 424 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.32 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  24.84 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  26.98 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.05 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  24.7 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  25.22 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.33 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  24.38 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  26.05 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  25.27 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.52 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.09 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  26.34 
 
 		 575 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0916  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.6 
 
 		 1038 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.150361 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.61 
 
 		 541 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  26.58 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  21.72 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  23.1 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  23.88 
 
 		 419 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.76 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0136  D-alanine/D-alanine ligase  35.58 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.87 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.25 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.18 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  26.62 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.38 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.91 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0459  phosphoribosylamine--glycine ligase  23.97 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.08 
 
 		 1049 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.31 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  24.58 
 
 		 313 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>