267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2020 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 
407 aa  841    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  28.44 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.18 
 
 
398 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.99 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  30.69 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  32.16 
 
 
419 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  32.03 
 
 
756 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.99 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  27.99 
 
 
407 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.31 
 
 
402 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.11 
 
 
420 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.3 
 
 
412 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  31.06 
 
 
411 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.54 
 
 
409 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.8 
 
 
389 aa  99.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.3 
 
 
432 aa  99.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  25.4 
 
 
420 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.69 
 
 
410 aa  96.3  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  31.11 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  31.7 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.08 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.67 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  27.87 
 
 
431 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.27 
 
 
900 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.27 
 
 
914 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.16 
 
 
409 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.27 
 
 
900 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  30.11 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.16 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  28.12 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  29.18 
 
 
924 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  24.76 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  28.96 
 
 
926 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  23.99 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.73 
 
 
891 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 
896 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 
894 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 
904 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  27.44 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.54 
 
 
723 aa  83.2  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.6 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.22 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 
904 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  33.87 
 
 
912 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  32.25 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.82 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.3 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  25.77 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.96 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.37 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  29.06 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  29.06 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  29.06 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  28.29 
 
 
1033 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.95 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.19 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  30.7 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  31.68 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.08 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  27.27 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  29.44 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  30.48 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.83 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.83 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.35 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  27.88 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.56 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  27.37 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  28.11 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  27.45 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  26.5 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  26.5 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  25.25 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  25.83 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  28.02 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  23.18 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.71 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  28.24 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  25.1 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6148  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.631903 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  29.36 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  28.64 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  24.19 
 
 
449 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0240  hypothetical protein  22.37 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4524  Biotin carboxylase-like protein  24.79 
 
 
403 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.799309  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  22.56 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  22.56 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.71 
 
 
541 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  29.28 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.32 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0240  hypothetical protein  23.15 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  27.83 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  26.3 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.71 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.71 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  28.74 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  28.74 
 
 
260 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.71 
 
 
403 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  29.05 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0732  hypothetical protein  29.78 
 
 
382 aa  59.7  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>