91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4786 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  809    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  65.16 
 
 		 402 aa  521  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  50.75 
 
 		 399 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  48.87 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  47.97 
 
 		 394 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  46.46 
 
 		 388 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  42.97 
 
 		 403 aa  315  8e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  45.57 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  39.46 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  41.2 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  43.75 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  28.83 
 
 		 891 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.71 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.15 
 
 		 924 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.67 
 
 		 926 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.15 
 
 		 912 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.33 
 
 		 904 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.33 
 
 		 904 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  29.85 
 
 		 894 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.38 
 
 		 896 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.99 
 
 		 900 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.99 
 
 		 914 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.99 
 
 		 900 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.5 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  22.26 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.52 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.52 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  22.41 
 
 		 409 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.01 
 
 		 756 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  25.81 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  25.81 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  25.81 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  26.21 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.45 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  28.17 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.03 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.94 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.18 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.82 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.14 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  26.92 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  26.55 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  26.55 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  23.58 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.3 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.29 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.36 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.05 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.19 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.25 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.01 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.59 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  26.55 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  24.56 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.62 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.32 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  29.57 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.51 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.91 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.7 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  25.09 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  27.07 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.16 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.1 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.03 
 
 		 1060 aa  50.1  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  24.42 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  28.75 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.75 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  28.75 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  27.68 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.94 
 
 		 541 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  27.46 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  30.72 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.69 
 
 		 1057 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.81 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  25.1 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  25.52 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2581  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.35 
 
 		 1109 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0874  nikkomycin biosynthesis domain protein  23.81 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  24.55 
 
 		 575 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1065 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.17 
 
 		 1078 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  24.27 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2272  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.98 
 
 		 1030 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  24.77 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.35 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  23.51 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0275  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  20.18 
 
 		 1074 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6412  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  28.44 
 
 		 656 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792756  normal  0.0296411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>