91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3091 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  100 
 
 		 394 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  72.84 
 
 		 399 aa  554  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  55.36 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  53.42 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  49.61 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  47.97 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  46.85 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  43.84 
 
 		 411 aa  322  7e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  41.04 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  40.84 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  42.04 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.15 
 
 		 891 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.38 
 
 		 924 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 904 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 894 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 896 aa  93.2  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 926 aa  92.8  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 912 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  32.55 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  29.24 
 
 		 904 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.62 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  32.21 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  28.09 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  28.74 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  27.2 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.21 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  21.63 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  21.63 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.1 
 
 		 900 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24.1 
 
 		 914 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24.1 
 
 		 900 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.33 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  27.98 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  23.9 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.62 
 
 		 756 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  26.16 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.5 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.34 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  22.82 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.36 
 
 		 543 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  32.14 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.17 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.02 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  28.24 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  25.22 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  24.84 
 
 		 441 aa  52.8  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.03 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  25.59 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  25.59 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.17 
 
 		 541 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  26.27 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  28.74 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.57 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.22 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.43 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.28 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  30.32 
 
 		 424 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.02 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  30.32 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.51 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.78 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.25 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  30.06 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  29.81 
 
 		 1033 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.72 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.61 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  26.79 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.42 
 
 		 420 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1057 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.88 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.37 
 
 		 1057 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3743  carbamoyl phosphate synthase large subunit  29.91 
 
 		 1112 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0558638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  25.83 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  23.48 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1717  hypothetical protein  27.73 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000202258 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.63 
 
 		 422 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5241  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.72 
 
 		 1099 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  27.16 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0769  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.49 
 
 		 1057 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.63 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.63 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  21.58 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0334  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.36 
 
 		 1090 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1784  D-alanine--D-alanine ligase  22.86 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  22.28 
 
 		 362 aa  43.1  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1298  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.39 
 
 		 1093 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0243124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2431  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.47 
 
 		 1143 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>