More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2663 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  100 
 
 		 413 aa  838    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  71.84 
 
 		 414 aa  580  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.56 
 
 		 723 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.84 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  29.08 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  27.18 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.68 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.58 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.69 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.61 
 
 		 424 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  28.99 
 
 		 756 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  25.14 
 
 		 404 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.24 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.48 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  28.12 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  28.12 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  28.87 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  28.06 
 
 		 424 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  28.06 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  24.59 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.57 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.32 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  26.07 
 
 		 543 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.4 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.85 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  30.24 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.49 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  25.48 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  28.76 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  28.76 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  29.9 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  29.81 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  27.51 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  29.49 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  26.56 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.33 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.19 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  21.57 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  22.39 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  30.71 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.13 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  29.77 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  26.05 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  25.96 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  25.6 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.34 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  26.27 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  24.28 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  21.69 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.16 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.34 
 
 		 914 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.34 
 
 		 900 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.34 
 
 		 900 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.04 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  21.97 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  21.21 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  27 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 		 726 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.26 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.92 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.86 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.85 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  19.82 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  25.61 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  27.6 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  19.88 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.64 
 
 		 924 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1088  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.63 
 
 		 1157 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.23 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1217  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.63 
 
 		 1157 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.78 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.49 
 
 		 926 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2572  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  28.4 
 
 		 1073 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0164695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2023  hypothetical protein  25.71 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.75 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  28.31 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  28.51 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0917  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.58 
 
 		 1131 aa  56.6  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2340  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.75 
 
 		 1110 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1419  Urea carboxylase  27.24 
 
 		 1207 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  24.76 
 
 		 891 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  28.39 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  27.63 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  23.2 
 
 		 904 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  25.09 
 
 		 1033 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  23.2 
 
 		 904 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  22.6 
 
 		 740 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1022  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.32 
 
 		 1157 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  23.05 
 
 		 912 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2127  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.67 
 
 		 1086 aa  54.3  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.33 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.33 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  23.49 
 
 		 894 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  23.33 
 
 		 896 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1254  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25 
 
 		 1074 aa  53.5  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.179154  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0085  carbamoylphosphate synthase large subunit  24 
 
 		 1127 aa  53.1  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.49 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.34 
 
 		 1073 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0283  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.79 
 
 		 1053 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.85267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>