283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2959 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 405 aa  824    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  40.67 
 
 		 411 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  39.53 
 
 		 412 aa  276  5e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  38.31 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  34.81 
 
 		 723 aa  210  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  33.5 
 
 		 410 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  27.89 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  32.05 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  29.88 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  33.24 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.68 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.57 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.04 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.08 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  23.65 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  25.06 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  23.59 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  26.92 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  26.92 
 
 		 407 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  25.06 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.6 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  28.91 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  25.36 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  25 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  26.08 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  24.29 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  23.87 
 
 		 756 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  24.78 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  24.49 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.37 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  24.39 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.16 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.79 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.96 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.83 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  23.43 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.33 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  21.96 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1688  phosphoribosylamine/glycine ligase  23.44 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1922  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.64 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.244182  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0318  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.64 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0201005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1035  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.64 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0832  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.64 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  22.63 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  23.73 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1188  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.13 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265969  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1196  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.13 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517415  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1349  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.13 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.608306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  22.69 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0979  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.62 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1128  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.26 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1122  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.23 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  27.63 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.02 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  27.63 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  24.56 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  27.24 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  23.96 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  24.43 
 
 		 894 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  24.29 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.48 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0488  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.84 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.79 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  25.33 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1246  phosphoribosylamine--glycine ligase  22.22 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2087  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.03 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  23.9 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0432  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  28.03 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000276786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  23.9 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  23.9 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.78 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0829  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.87 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.36 
 
 		 924 aa  57  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.34 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.78 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.78 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0473  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase ATPase subunit  26.32 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0397466  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  21.87 
 
 		 900 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.23 
 
 		 926 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  21.87 
 
 		 914 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5661  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.81 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  21.87 
 
 		 900 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  23.14 
 
 		 891 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  23.12 
 
 		 912 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2238  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.09 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2358  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.09 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.739555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0958  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.87 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1245  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  26.18 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.816462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  23.64 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.97 
 
 		 904 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1707  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.38 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.38 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  41.76 
 
 		 746 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.4 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.97 
 
 		 904 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  24.34 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0708  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  33.08 
 
 		 398 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.36 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2374  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.7 
 
 		 1071 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128175  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12301  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.08 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.795061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>