160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0899 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  99.75 
 
 
406 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  99.62 
 
 
260 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  99.62 
 
 
260 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  26.56 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  28.63 
 
 
436 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.45 
 
 
756 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 
914 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 
900 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.79 
 
 
900 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.06 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  22.19 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  29.18 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.45 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25.81 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.78 
 
 
723 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  28.09 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.84 
 
 
891 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.98 
 
 
924 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.93 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25.83 
 
 
926 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.93 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.55 
 
 
904 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.55 
 
 
904 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.14 
 
 
912 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  20.54 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25.75 
 
 
402 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  22.37 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  29.7 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.31 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.71 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.61 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.75 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  28.05 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.68 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  29.03 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  24.62 
 
 
402 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.22 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.42 
 
 
894 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  29.63 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  27.45 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.28 
 
 
896 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.48 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  27.56 
 
 
388 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.45 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.28 
 
 
409 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  27.34 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24.33 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  28.17 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  24.67 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.7 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  24.17 
 
 
403 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.9 
 
 
405 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  26.97 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.93 
 
 
410 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.87 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.38 
 
 
541 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.51 
 
 
543 aa  56.6  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.3 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  25.37 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.81 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.52 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  21.74 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.8 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.8 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.74 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  29.61 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.37 
 
 
405 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.13 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.13 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.43 
 
 
384 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  25 
 
 
422 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  26.18 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.26 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  21.6 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  21.6 
 
 
453 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0793  biotin carboxylase  26.96 
 
 
437 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  25.27 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23180  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  27.24 
 
 
1830 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.97809  normal  0.111796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  24.86 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  17.78 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5380  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP- binding protein  25.08 
 
 
1829 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0382396  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0416  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.6 
 
 
726 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.69 
 
 
1073 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3649  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.37 
 
 
455 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.931684  normal  0.513161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2088  D-alanine--D-alanine ligase  30.58 
 
 
304 aa  47.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3647  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.14 
 
 
1074 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  25.24 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  25.24 
 
 
414 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  23.64 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0939  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.29 
 
 
1068 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.245842  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  23.63 
 
 
404 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.57 
 
 
411 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  19.42 
 
 
431 aa  46.6  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  30.16 
 
 
355 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3207  putative biotin carboxylase protein  23.1 
 
 
449 aa  46.6  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301064  decreased coverage  0.00428909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1868  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  20.16 
 
 
1067 aa  46.6  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.75 
 
 
1096 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>