More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1401 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  78.47 
 
 		 412 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 409 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  43.81 
 
 		 411 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  38.31 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  32.19 
 
 		 723 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  31.4 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.37 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  31.76 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  31.22 
 
 		 411 aa  192  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  30.75 
 
 		 543 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  29.88 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.78 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.03 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  30.41 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  25.96 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.76 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  27.1 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  27.7 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  27.04 
 
 		 398 aa  96.3  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.17 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.17 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.16 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  27.57 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  25.88 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.93 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.61 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  25.23 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.27 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  24.25 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  24.76 
 
 		 756 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  27.27 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  28.19 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.68 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.31 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  21.88 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4510  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.926971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.23 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  26.61 
 
 		 900 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4671  D-alanine--D-alanine ligase  28.99 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129578  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  25.78 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  25.47 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4385  D-alanine--D-alanine ligase  30.3 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0215233  normal  0.165436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  26.61 
 
 		 914 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  26.61 
 
 		 900 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  25.47 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0946  D-alanine--D-alanine ligase  30.81 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0924  D-alanine--D-alanine ligase  30.68 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.783773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1339  D-alanine--D-alanine ligase  29.8 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266833  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.84 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  21.36 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0029  protein of unknown function DUF201  22.03 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  30.68 
 
 		 319 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1454  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.01 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  26.14 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  28.79 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  27.8 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  26.07 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57320  D-alanine--D-alanine ligase  30.11 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.61 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1824  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.91 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  26.36 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0191  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.6 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.38 
 
 		 924 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  27.24 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.38 
 
 		 894 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.17 
 
 		 896 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.17 
 
 		 926 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1395  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.92 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4148  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.23 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  28.43 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.79 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.1 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  26.21 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2079  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  26.13 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1359  3-methylcrotonyl-CoA carboxylase alpha subunit  27.05 
 
 		 673 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  25.77 
 
 		 904 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  25.77 
 
 		 904 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0452  D-alanine/D-alanine ligase  29.61 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0742321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.19 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.5 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.3 
 
 		 891 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  25.57 
 
 		 912 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.05 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4406  D-alanine--D-alanine ligase  27.54 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4100  D-alanine--D-alanine ligase  28.81 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.555114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2052  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.9 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25.28 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  29.41 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2715  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  23.08 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2815  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.55 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06950  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.42 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.414561  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0738  3-methylcrotonoyl-CoA carboxylase, alpha subunit  27.03 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.623779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2564  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  25.56 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  33.63 
 
 		 877 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  33.63 
 
 		 877 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>