More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3626 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  100 
 
 
432 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  41.98 
 
 
415 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  39.18 
 
 
416 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  42.68 
 
 
404 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  31.29 
 
 
407 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  31.29 
 
 
407 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  35.18 
 
 
756 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  31.09 
 
 
420 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.78 
 
 
410 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.69 
 
 
411 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  28.4 
 
 
402 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.88 
 
 
412 aa  102  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  29.54 
 
 
404 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
900 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
914 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.3 
 
 
399 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  31.77 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.3 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.05 
 
 
723 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  32.97 
 
 
900 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  30.08 
 
 
891 aa  97.8  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  30.36 
 
 
924 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  35.54 
 
 
419 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  23.87 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  30.19 
 
 
926 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  30.58 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  30.16 
 
 
904 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  29.86 
 
 
904 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  29.73 
 
 
912 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  30.08 
 
 
894 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  29.92 
 
 
896 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  27.12 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.31 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  26.07 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.93 
 
 
409 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  30.15 
 
 
437 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  31.79 
 
 
428 aa  87  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.6 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  33 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.24 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  28.34 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.19 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.23 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  27.64 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  29.18 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  29.18 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  29.18 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.89 
 
 
424 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  28.7 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.73 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  27.89 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  28.12 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  27.59 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  31.88 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0177  hypothetical protein  24.26 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.32 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  26.64 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  27.27 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  32.39 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  26.35 
 
 
413 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.53 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  27.44 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  24 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  27.49 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  29.96 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3242  hypothetical protein  27.54 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  24.51 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  25.52 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.45 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.45 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  27.16 
 
 
453 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  27.16 
 
 
453 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.9 
 
 
436 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  27.01 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  30.29 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  28.29 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  27.78 
 
 
1033 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06063  hypothetical protein  26.64 
 
 
349 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2846  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain- containing protein  24.24 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.435021  normal  0.117516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  26.97 
 
 
543 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.28 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  27.96 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  26.64 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  29.81 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.2 
 
 
541 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  30 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2886  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.7 
 
 
1082 aa  56.6  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.827795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.62 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  33.98 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3031  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.77 
 
 
1084 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.144026  decreased coverage  0.0049366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  26.52 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  28.46 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2639  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.3 
 
 
1105 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239677  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  33.81 
 
 
402 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.72 
 
 
393 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0875  hypothetical protein  26.6 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  27.6 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0043  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.8 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2214  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.75 
 
 
1072 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  27.56 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>