119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0730 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  891    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  27.14 
 
 		 441 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  28.86 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  28.86 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  28.86 
 
 		 406 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  27.02 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  21.88 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  21.88 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  25.98 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  25.98 
 
 		 914 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  22.16 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  25.98 
 
 		 900 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  26.28 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  22.66 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  26.75 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.16 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  24.1 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  24.1 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.9 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  26.98 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  27.34 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  21.88 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.71 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25.94 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  24.18 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  24.22 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  23.66 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  26.69 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.09 
 
 		 891 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  24.8 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.37 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.46 
 
 		 723 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  22.81 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  23.03 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.9 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  25.58 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  24.36 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.22 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  27.98 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0791  biotin carboxylase  25.47 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3660  hypothetical protein  28.28 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  23.21 
 
 		 924 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  23.05 
 
 		 926 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  23.98 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  21.11 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  25.58 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  27.88 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  27.88 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  22.86 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2986  carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.36 
 
 		 431 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.556183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.02 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  22.86 
 
 		 904 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  22.7 
 
 		 912 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  24.38 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  24.46 
 
 		 894 aa  56.2  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.19 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2162  hypothetical protein  22.22 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  23.77 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  21.81 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  24.26 
 
 		 896 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0793  biotin carboxylase  27.05 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  27.2 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3256  putative carbamoyl-phosphate synthase large chain  23.36 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5515  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.58 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5879  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.58 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521142  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.33 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3469  hypothetical protein  24.15 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6388  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.58 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357309  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.49 
 
 		 400 aa  53.9  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.81 
 
 		 411 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.36 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  26.49 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  21.36 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  22.42 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0072  hypothetical protein  22.42 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  24.03 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6149  hypothetical protein  27.2 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  21.3 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  22.12 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  26.05 
 
 		 388 aa  50.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3467  hypothetical protein  22.73 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4069  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  20.33 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2209  CarB family protein  24.09 
 
 		 543 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.304362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  25 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4982  D-alanine--D-alanine ligase  25.81 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.7 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1007  hypothetical protein  25.39 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  24.09 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4572  D-alanine--D-alanine ligase  28.5 
 
 		 331 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0772  D-alanine--D-alanine ligase  25.21 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.170719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2188  D-alanine--D-alanine ligase  26.67 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.441149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13270  D-alanine--D-alanine ligase  26.7 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.122637  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  23.91 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  24.52 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  25.44 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  26.9 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  25.57 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>