More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2022 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  99.67 
 
 
914 aa  1778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  99.78 
 
 
900 aa  1778    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  100 
 
 
900 aa  1783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  40.07 
 
 
926 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  40.15 
 
 
924 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
904 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  39.98 
 
 
904 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  40.15 
 
 
896 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  40.24 
 
 
894 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  40.09 
 
 
891 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  39.52 
 
 
912 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2437  fumarate lyase  38.04 
 
 
477 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4386  argininosuccinate lyase  34.2 
 
 
499 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  37.81 
 
 
756 aa  198  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  39.16 
 
 
410 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0852  argininosuccinate lyase  36.62 
 
 
492 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00169507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  33.18 
 
 
467 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  32.33 
 
 
462 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  32.33 
 
 
462 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
463 aa  188  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
462 aa  187  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  34.46 
 
 
475 aa  187  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2700  argininosuccinate lyase  37.14 
 
 
478 aa  187  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.622562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  35.36 
 
 
455 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0576  argininosuccinate lyase  33.71 
 
 
492 aa  187  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000000512851  decreased coverage  0.000219195 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  31.78 
 
 
462 aa  187  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  31.78 
 
 
462 aa  187  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
462 aa  187  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  32.05 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  34.6 
 
 
478 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  31.78 
 
 
462 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  32.97 
 
 
469 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  31.51 
 
 
462 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  31.51 
 
 
462 aa  183  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0979  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
459 aa  182  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.248554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3670  argininosuccinate lyase  32.72 
 
 
469 aa  182  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122063  normal  0.27596 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0960  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
459 aa  182  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0731187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  31.34 
 
 
464 aa  181  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  33.09 
 
 
467 aa  180  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  33.65 
 
 
460 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  32.74 
 
 
467 aa  179  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3642  hypothetical protein  36.39 
 
 
520 aa  178  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0304032  normal  0.123146 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  32.78 
 
 
461 aa  177  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0004  argininosuccinate lyase  30.58 
 
 
491 aa  177  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2475  argininosuccinate lyase  33.75 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  33.03 
 
 
458 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4875  argininosuccinate lyase  35.03 
 
 
488 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  31.75 
 
 
481 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  35.13 
 
 
458 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
457 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  33.85 
 
 
462 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  32.86 
 
 
476 aa  175  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69500  argininosuccinate lyase  32.04 
 
 
464 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0492  argininosuccinate lyase  33.06 
 
 
487 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6009  argininosuccinate lyase  32.04 
 
 
464 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  35.13 
 
 
458 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2673  argininosuccinate lyase  34.23 
 
 
468 aa  174  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973964  hitchhiker  0.00000000000598016 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  31.65 
 
 
469 aa  174  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0745  argininosuccinate lyase  33.97 
 
 
471 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.470577  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3732  argininosuccinate lyase  32.35 
 
 
463 aa  174  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.663919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  29.05 
 
 
458 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0206  argininosuccinate lyase  31.26 
 
 
499 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  35.09 
 
 
459 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0184  argininosuccinate lyase  31.26 
 
 
468 aa  174  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0088  argininosuccinate lyase  32.98 
 
 
457 aa  173  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2445  argininosuccinate lyase  36.59 
 
 
471 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10802  normal  0.34117 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3955  argininosuccinate lyase  34.47 
 
 
499 aa  173  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  32.41 
 
 
461 aa  174  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5512  argininosuccinate lyase  36.86 
 
 
462 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  30.56 
 
 
462 aa  172  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  29.66 
 
 
462 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2359  argininosuccinate lyase  34.11 
 
 
464 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  31.15 
 
 
459 aa  173  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  33.24 
 
 
461 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0209  argininosuccinate lyase  31.03 
 
 
464 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.822129  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  32.11 
 
 
468 aa  172  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0263  argininosuccinate lyase  30.21 
 
 
485 aa  172  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0999182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3381  argininosuccinate lyase  35.6 
 
 
476 aa  172  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.407242 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0548  argininosuccinate lyase  30.49 
 
 
463 aa  171  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  32.81 
 
 
458 aa  172  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  30.71 
 
 
461 aa  171  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  33.6 
 
 
464 aa  171  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002315  argininosuccinate lyase/N-acetylglutamate synthase  32.1 
 
 
624 aa  171  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.784515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0260  argininosuccinate lyase  34.46 
 
 
456 aa  171  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0664  argininosuccinate lyase  33.02 
 
 
441 aa  170  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1168  argininosuccinate lyase  26.93 
 
 
487 aa  170  9e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1728  argininosuccinate lyase  33.57 
 
 
470 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.365452  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  33.95 
 
 
464 aa  170  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2381  argininosuccinate lyase  35.33 
 
 
471 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0522  argininosuccinate lyase  32.06 
 
 
467 aa  170  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2875  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 
462 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.717741  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1061  argininosuccinate lyase  36.18 
 
 
469 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0254  argininosuccinate lyase  31.26 
 
 
464 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  33.33 
 
 
463 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2677  argininosuccinate lyase  33.42 
 
 
469 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0937  argininosuccinate lyase  30.03 
 
 
470 aa  169  2e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.941991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0197  argininosuccinate lyase  35.56 
 
 
457 aa  169  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.274279  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3277  argininosuccinate lyase  35.99 
 
 
462 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0864  argininosuccinate lyase  36.18 
 
 
469 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0238931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4778  argininosuccinate lyase  33.97 
 
 
457 aa  169  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>