92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001066 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  100 
 
 		 403 aa  834    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  51.6 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3091  PvsA  49.61 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1279  hypothetical protein  45.81 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.406455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  46.09 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3136  putative siderophore biosynthesis protein  45.78 
 
 		 388 aa  336  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  42.97 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  44.2 
 
 		 402 aa  288  9e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  36.57 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  35.59 
 
 		 402 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  34.93 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  25.19 
 
 		 924 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  24.7 
 
 		 914 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 926 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  24.7 
 
 		 900 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25 
 
 		 891 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  24.63 
 
 		 904 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  24.7 
 
 		 900 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  25.9 
 
 		 894 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  24.63 
 
 		 904 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  25.69 
 
 		 896 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  24.45 
 
 		 912 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.86 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.86 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.09 
 
 		 411 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  27.57 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  28.21 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  25.09 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  23.65 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  24.8 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  24.49 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.82 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.01 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  22.7 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0449  putative glycolate oxidase  24.76 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  23.44 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  22.16 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  24.52 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  24.17 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0619  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.34 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.241949  hitchhiker  0.00233057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2440  biotin carboxylase-like  27.55 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  30.04 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  21.77 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  20.06 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1518  protein of unknown function DUF201  27.55 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2663  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  22.53 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3093  hypothetical protein  29.17 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.27 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0875  hypothetical protein  27 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1423  protein of unknown function DUF201  27.55 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  21.71 
 
 		 756 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  23.41 
 
 		 398 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.8 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  30.28 
 
 		 575 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.47 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.39 
 
 		 541 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  22.07 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0418  hypothetical protein  24.62 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1642  hypothetical protein  24.31 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2329  D-alanine--D-alanine ligase  21.99 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.304126  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26 
 
 		 1079 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.69 
 
 		 412 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.12 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.46 
 
 		 1068 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.03 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  23.14 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0712  D-alanine--D-alanine ligase domain-containing protein  28.87 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.396337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  24.77 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.29 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  26 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  28.49 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3590  D-alanine--D-alanine ligase  29.75 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.49 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.09 
 
 		 326 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  22.22 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3673  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.32 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1514  hypothetical protein  24.65 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0194  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein ATP-grasp  22.74 
 
 		 419 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.34 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.34 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1207  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.46 
 
 		 1059 aa  43.5  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37283  predicted protein  26.53 
 
 		 1033 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  23.3 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2148  hypothetical protein  25.87 
 
 		 414 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3064  hypothetical protein  23.04 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000514586 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  23.9 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  22.01 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  22.37 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03057  hypothetical protein  22.03 
 
 		 449 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.450613  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>