33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3365 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  100 
 
 		 384 aa  786    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1584  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  32.04 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2668  phosphoribosylglycinamide synthetase  26.64 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  21.37 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.28 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2144  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.8 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.79 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  24.39 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  26.37 
 
 		 382 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  24.38 
 
 		 428 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  23.17 
 
 		 402 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  22.94 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  23.43 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14410  carbamoylphosphate synthase large subunit  23.75 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  23.43 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  23.43 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  23.43 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  23.43 
 
 		 260 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1390  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  29.27 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.833755  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  23.63 
 
 		 723 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  25.76 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1724  protein of unknown function DUF201  23.96 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1498  biotin carboxylase-like  25.11 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  25.52 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.98 
 
 		 1075 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.98 
 
 		 1064 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  27.06 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0124  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.76 
 
 		 938 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  29.22 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1042  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.98 
 
 		 1060 aa  43.9  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.19 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  24.41 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  22.01 
 
 		 403 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>