64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2365 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0732  hypothetical protein  99.62 
 
 
406 aa  517  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0899  hypothetical protein  99.62 
 
 
406 aa  517  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2365  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2713  biotin carboxylase  100 
 
 
260 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0718  hypothetical protein  99.62 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.555879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0754  protein of unknown function DUF201  25.47 
 
 
409 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  28.38 
 
 
900 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  28.38 
 
 
914 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  28.38 
 
 
900 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4500  Cysteine synthase  29.59 
 
 
756 aa  72.4  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.632569  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  22.52 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  22.52 
 
 
407 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2020  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.74 
 
 
407 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0730  hypothetical protein  27.33 
 
 
436 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2428  protein of unknown function DUF201  26.24 
 
 
402 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.281403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3759  protein of unknown function DUF201  31.69 
 
 
425 aa  59.3  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1270  protein of unknown function DUF201  19.93 
 
 
399 aa  57.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.964812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2737  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.44 
 
 
723 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2646  argininosuccinate lyase  27.5 
 
 
904 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1396  argininosuccinate lyase  26.37 
 
 
926 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  26.37 
 
 
924 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2507  argininosuccinate lyase  27.5 
 
 
912 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2122  argininosuccinate lyase  26.37 
 
 
894 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2560  argininosuccinate lyase  26.37 
 
 
904 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1620  argininosuccinate lyase  26.37 
 
 
896 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  31.18 
 
 
410 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0996  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.87 
 
 
541 aa  55.8  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4068  hypothetical protein  21.43 
 
 
413 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2251  phosphoribosylglycinamide synthetase  30.51 
 
 
418 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000511987 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.2 
 
 
410 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  26.63 
 
 
891 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2135  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.52 
 
 
412 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165665  normal  0.504192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6153  protein of unknown function DUF201  25.41 
 
 
397 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3365  putative carbamoyl-phosphate-synthetase protein  23.43 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131382  normal  0.291758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3552  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain-containing protein  26.05 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138111  normal  0.272734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4786  hypothetical protein  28.75 
 
 
398 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0344  phosphoribosylglycinamide synthetase  24.65 
 
 
424 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0721  hypothetical protein  27.91 
 
 
402 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.446517 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  25.93 
 
 
411 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.73 
 
 
420 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3748  protein of unknown function DUF201  25.76 
 
 
388 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.277412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3265  hypothetical protein  25.86 
 
 
412 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  30.16 
 
 
355 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09340  hypothetical protein  30.07 
 
 
399 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.035454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2969  hypothetical protein  24.69 
 
 
402 aa  45.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01931  vibrioferrin biosynthesis protein PvsA  28.08 
 
 
399 aa  45.8  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1432  hypothetical protein  30.6 
 
 
424 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502147  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2959  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.81 
 
 
405 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2595  putative carbamoyl-phosphate-synthetase  22.02 
 
 
398 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605395  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  23.46 
 
 
405 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0793  biotin carboxylase  28.16 
 
 
437 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0912  biotin carboxylase-like protein  24.81 
 
 
410 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.527326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0755  protein of unknown function DUF201  20.83 
 
 
398 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1401  protein of unknown function DUF201  25 
 
 
409 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1119  biotin carboxylase  23.43 
 
 
411 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1388  hypothetical protein  24.23 
 
 
395 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44930  predicted protein  26.21 
 
 
575 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.541672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8363  putative siderophore biosynthesis protein  25.87 
 
 
401 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4142  hypothetical protein  24.64 
 
 
414 aa  42.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16964  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0006  hypothetical protein  25.14 
 
 
387 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001066  vibrioferrin ligase/carboxylase protein PvsA  26.43 
 
 
403 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4090  hypothetical protein  24.64 
 
 
414 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.572464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3352  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  24.24 
 
 
449 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3207  putative biotin carboxylase protein  23.11 
 
 
449 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301064  decreased coverage  0.00428909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>