113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1666 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  710    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  36.87 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  36.15 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  34.58 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  32.67 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  30.77 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  27.76 
 
 		 349 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  32.09 
 
 		 381 aa  95.9  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  28.47 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  26.2 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  25.07 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  26.06 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  29.24 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  26.33 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  26.26 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  26.29 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  27.75 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  26.62 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  24.68 
 
 		 403 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  28.95 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  29.19 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  31.35 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  27.23 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  27.85 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  24.93 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  25.78 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  24.35 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  32.53 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  25.39 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  24.14 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  25.24 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1011  Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  24.12 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.649609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  29.08 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0850  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.67 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2418  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.7 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  24 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  25.13 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  29.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.08 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2118  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  20.13 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.98 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1834  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.88 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1598  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.69 
 
 		 1042 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2124  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  25.68 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01820  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1792  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00174349  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  30.25 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01808  hypothetical protein  22.98 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2079  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2805  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.15 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0443312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1338  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  28 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1941  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0660  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  24.35 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.127556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1783  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.98 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02115  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.58 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003700  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  23.23 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.497623  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  25.89 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2456  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.07 
 
 		 1096 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2242  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  20.81 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30161  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.71 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.251731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  28.36 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2584  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.93 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.303586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0305  carbamoyl phosphate synthase large subunit  31.25 
 
 		 1089 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1692  carbamoyl phosphate synthase large subunit  31.25 
 
 		 1089 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  30.48 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0534  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  25.15 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760232 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.33 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2103  ribosomal protein S6 modification protein  28.86 
 
 		 301 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  20.63 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6005  hypothetical protein  36.11 
 
 		 447 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  27.94 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 1147 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  33.82 
 
 		 1147 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0327  carbamoyl phosphate synthase large subunit  30.21 
 
 		 1089 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.92 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.92 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2807  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.55 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  26.72 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  28.36 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1133  protein of unknown function DUF201  24.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2669  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.48 
 
 		 1069 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2084  hypothetical protein  26.63 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0903485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.96 
 
 		 1062 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1555  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  20.85 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1634  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.5 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2447  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  21.5 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2446  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  22.42 
 
 		 1106 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2246  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.9 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1700  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.74 
 
 		 1496 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1078 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0081  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.22 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.338109 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  26.28 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  32.12 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.44 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13230  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.91 
 
 		 1093 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.94923  normal  0.975818 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1686  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  22.58 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>