295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0197 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  798    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  46.18 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  37.93 
 
 		 355 aa  226  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  36.05 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  34.64 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  35.25 
 
 		 357 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  34.63 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  31.43 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  24.39 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  25.19 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  26.42 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  24.8 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  23.31 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  25.88 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  24.27 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  26.82 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  24.7 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  25.84 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  28.51 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  22.03 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  29.15 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  23.54 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  28.91 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0741  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.93 
 
 		 1040 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1504  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  29.3 
 
 		 1049 aa  63.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000277903  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  25.64 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1684  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.96 
 
 		 1071 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000705985  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.87 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  27.78 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0753  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.08 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.564232 
 
 
-
 
NC_002950  PG0530  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.4 
 
 		 1075 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  25.33 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2070  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.58 
 
 		 1029 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  24.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.21 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  23.76 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3770  S6 modification enzyme RimK  25.55 
 
 		 302 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3296  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.28 
 
 		 1074 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2072  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.4 
 
 		 1083 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.471557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1096  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  27.98 
 
 		 1080 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.528087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1729  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.22 
 
 		 1077 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2208  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.22 
 
 		 1077 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1296  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.27 
 
 		 1031 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.163057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2118  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.22 
 
 		 1077 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.63 
 
 		 1054 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1462  protein of unknown function DUF201  26.52 
 
 		 318 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127358  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0882  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.32 
 
 		 1063 aa  52.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0779  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.09 
 
 		 1068 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0332696  hitchhiker  0.000231672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.52 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1521  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.4 
 
 		 1081 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 		 900 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 		 900 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  27.08 
 
 		 914 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  26.99 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.7 
 
 		 1065 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  26.38 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1703  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24 
 
 		 1051 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0996  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.34 
 
 		 1075 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.846706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6005  hypothetical protein  26.6 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0699  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.66 
 
 		 1077 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.133334  normal  0.0796001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  26.32 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0990  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.23 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.587496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  25.17 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1370  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.05 
 
 		 1095 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  30.1 
 
 		 301 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1990  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.75 
 
 		 1046 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.950925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0115  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.62 
 
 		 1056 aa  51.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1446  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.47 
 
 		 1066 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2806  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.23 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1085  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  24.23 
 
 		 1080 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  24.03 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1864  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.45 
 
 		 1082 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000611023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1254  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.28 
 
 		 1074 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.179154  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  26.11 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4702  protein of unknown function DUF201  26.03 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0701331  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24195  CPS III, carbamoyl-phosphate synthase mitochindrial precursor  22.77 
 
 		 1463 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0949  carbamoyl phosphate synthase large subunit  21.72 
 
 		 1072 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.742849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0925  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.42 
 
 		 939 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.49458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  23.24 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2563  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25 
 
 		 1056 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0352  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.93 
 
 		 1075 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000999114  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0135  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.91 
 
 		 1025 aa  50.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0153019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1732  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.29 
 
 		 1076 aa  50.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1670  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.94 
 
 		 1078 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2175  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.26 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321083  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12690  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  25.66 
 
 		 1118 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359466  normal  0.0639836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  26.56 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2426  pyruvate carboxylase subunit A  25.54 
 
 		 498 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2232  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.04 
 
 		 1079 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  24.02 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.76 
 
 		 1078 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1047  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.61 
 
 		 1065 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  25.89 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4534  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.57 
 
 		 1067 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1039  hypothetical protein  26.24 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3192  argininosuccinate lyase  27.8 
 
 		 924 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1004  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.61 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.777466  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0968  carbamoyl phosphate synthase large subunit  20.61 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0639  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  21.98 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>