50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3436 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  649    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  48.25 
 
 		 307 aa  288  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  42.54 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  39.63 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  36.14 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  36.11 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  36.99 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  35.02 
 
 		 301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  28.76 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  28.25 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  27.49 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  27.3 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  21.29 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  26.95 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  24.22 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  24.48 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  23.4 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  24.71 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  26.48 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  21.02 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  26.05 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  23.44 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  20.9 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  24.42 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  22.97 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  22.97 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  24.52 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  31.86 
 
 		 357 aa  49.7  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  24.38 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1312  D-alanine--D-alanine ligase  26.8 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0281442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1522  D-alanine--D-alanine ligase  26.8 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0539481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  21.49 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0567  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.63 
 
 		 1157 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0354318  normal  0.109208 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2390  D-alanine--D-alanine ligase  25.31 
 
 		 304 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.593473  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0479  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  26.41 
 
 		 1075 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  26.11 
 
 		 391 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0816  D-alanine--D-alanine ligase  24.88 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1022  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.49 
 
 		 1157 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2356  D-alanine--D-alanine ligase  25.41 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2741  D-alanine--D-alanine ligase  23.08 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199895  hitchhiker  0.00000666317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2582  D-alanine--D-alanine ligase  23.59 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2435  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2627  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105454 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2610  D-alanine--D-alanine ligase  25 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.5132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1217  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.76 
 
 		 1157 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1088  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.76 
 
 		 1157 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.464939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2666  D-alanine--D-alanine ligase  23.2 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.555621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2628  D-alanine--D-alanine ligase  23.2 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.292335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>