31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0581 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  100 
 
 
295 aa  597  1e-169  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  60 
 
 
295 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  60.68 
 
 
295 aa  348  9e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  58.64 
 
 
299 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  51.01 
 
 
301 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  36.99 
 
 
319 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  34.19 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  34.42 
 
 
299 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  31 
 
 
311 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  25.98 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  26.89 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  27.66 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  25.47 
 
 
302 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  27.38 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  25.94 
 
 
366 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  28.14 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  27.97 
 
 
319 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  27.56 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  27.13 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  28 
 
 
360 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  27.97 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  26.92 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  25.13 
 
 
357 aa  55.8  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  30.1 
 
 
299 aa  55.8  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  25.52 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  25.31 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  25.43 
 
 
391 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4160  D-alanine/D-alanine ligase  25.45 
 
 
333 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  25.5 
 
 
306 aa  43.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2222  hypothetical protein  23.11 
 
 
354 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  25.22 
 
 
663 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>