18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0283 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 360 aa  733    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  30.03 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  28.81 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  30.08 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  27.8 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  26.59 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  28.74 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  27.54 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  25.83 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  25.7 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  29.02 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  24.42 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  25.97 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  28 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  28.57 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  21.81 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  25.29 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  24.89 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>