37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1384 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  63.73 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  60 
 
 		 295 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  56.51 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  52.35 
 
 		 301 aa  316  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  39.63 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  37.9 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  35.9 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  26.96 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  26.76 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  26.41 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  26.41 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  30 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  28.4 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  28.43 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  27.98 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  30.86 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  27.43 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  24.85 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  29.02 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  30.88 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  25.89 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  31.71 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  28.36 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  28.37 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  26.29 
 
 		 357 aa  50.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  29.1 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  28.57 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.02 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.02 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0360  D-alanine--D-alanine ligase  25.37 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  25.29 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  25.43 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  22.86 
 
 		 346 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1971  argininosuccinate lyase  25.47 
 
 		 891 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>