24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2621 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  617  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  54.92 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  49.39 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  49.7 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  49.7 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  47.08 
 
 		 350 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  33.03 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  34.56 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  39.82 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  32.73 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  33.65 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  28.8 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  29.21 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  27.97 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  28.93 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  30.86 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  20 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  20.69 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  19.32 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  20.13 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  26.24 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  21.78 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  33.51 
 
 		 415 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>