33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0920 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  63.73 
 
 
295 aa  378  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  60.68 
 
 
295 aa  348  9e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  56.95 
 
 
299 aa  340  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  54.03 
 
 
301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  36.14 
 
 
319 aa  185  9e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  37.34 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  34.53 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  28.77 
 
 
311 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  27.1 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  28.96 
 
 
302 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  28.38 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  26.1 
 
 
302 aa  85.5  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  26.76 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  28.91 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  28.57 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  28.24 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  29.22 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  23.94 
 
 
357 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  26.67 
 
 
319 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  27.5 
 
 
357 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  27.86 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  26.1 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  23.56 
 
 
357 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  24.77 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  31.16 
 
 
265 aa  46.6  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1240  D-alanine--D-alanine ligase  26.04 
 
 
306 aa  45.8  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  26.42 
 
 
391 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  25.57 
 
 
483 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  26.43 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  24.66 
 
 
346 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  25.45 
 
 
353 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  28.21 
 
 
360 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>