29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5936 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  42.73 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  46.67 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  46.77 
 
 		 319 aa  225  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  41.82 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  39.76 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  33.02 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  32.91 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  34.08 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  31.4 
 
 		 330 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  29.52 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  26.27 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  28.74 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  26.48 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  19.25 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  25.77 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  25.64 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  26.07 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  25.57 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  21.69 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  26.64 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  26.29 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  21.67 
 
 		 327 aa  50.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1140  D-alanine--D-alanine ligase  28.64 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000909084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0588  carbamoyl phosphate synthase-like protein  22.03 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4856  protein of unknown function DUF201  24.78 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1350  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.7 
 
 		 1086 aa  42.7  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.501423  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1287  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.27 
 
 		 1057 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.867856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1262  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.27 
 
 		 1057 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>