22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3138 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  51.2 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2621  hypothetical protein  48.81 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5936  hypothetical protein  46.67 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2459  hypothetical protein  43.96 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.243354 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6502  hypothetical protein  43.77 
 
 		 357 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.868447  normal  0.0200511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  31.27 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  39.15 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1790  hypothetical protein  35.22 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.269411  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2868  hypothetical protein  34.72 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.430946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3530  hypothetical protein  29.04 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.582782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0571  hypothetical protein  28.47 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0897117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0283  protein of unknown function DUF201  25.7 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  27.98 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0581  protein of unknown function DUF201  28.14 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0946746  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  28.23 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  20.58 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  25.58 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  20.9 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0920  hypothetical protein  26.1 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0220945  hitchhiker  0.000000000622111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  40.62 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2725  hypothetical protein  44.74 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153726  normal  0.114975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>