110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3475 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  80.87 
 
 
305 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  79.87 
 
 
305 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  79.19 
 
 
305 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  41.04 
 
 
329 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.56 
 
 
326 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.56 
 
 
326 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.56 
 
 
326 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  40 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  42.55 
 
 
328 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.34 
 
 
324 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  40.91 
 
 
328 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  37.58 
 
 
327 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  37.58 
 
 
327 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  42.8 
 
 
311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  39.31 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  39.31 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  42.81 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  40.32 
 
 
351 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  42.22 
 
 
315 aa  210  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  42.22 
 
 
315 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  38.41 
 
 
318 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  39.6 
 
 
320 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  38.41 
 
 
318 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  38.95 
 
 
329 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  39.1 
 
 
334 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.06 
 
 
314 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.19 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  38.6 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.41 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.41 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.72 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.06 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.02 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  38.95 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.02 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  38.38 
 
 
322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  37.36 
 
 
314 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.65 
 
 
320 aa  194  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.5 
 
 
316 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.42 
 
 
330 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  36.01 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.29 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.28 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.29 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  26.72 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  29.69 
 
 
440 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  28.46 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  28.43 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  28.57 
 
 
390 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  28.38 
 
 
380 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  27.34 
 
 
375 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.31 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  28.7 
 
 
428 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  32.9 
 
 
400 aa  53.1  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  25.67 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3062  hypothetical protein  29.58 
 
 
438 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.147706  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  28.79 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  26.97 
 
 
289 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  28.1 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  24.16 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.51 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0680  hypothetical protein  29.58 
 
 
439 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  25.67 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.72 
 
 
302 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.72 
 
 
302 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  25.96 
 
 
292 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  25.38 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  29.03 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  27.13 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.08 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  28.46 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  30.23 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3138  hypothetical protein  40.62 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  25.81 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  26.77 
 
 
597 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  31.3 
 
 
459 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  25.19 
 
 
301 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  23.79 
 
 
298 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.2 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  45 
 
 
282 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  26.05 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  31.3 
 
 
471 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2024  alpha-L-glutamate ligase  26.89 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.095015  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  26.01 
 
 
593 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.86 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  31.3 
 
 
456 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  23.05 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>