43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2008 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  882    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  73.15 
 
 		 440 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  65.76 
 
 		 434 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  37.96 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1213 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3062  hypothetical protein  24.11 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.147706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  30.64 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  25.98 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  30.34 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  28.09 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  28.38 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  24.5 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0680  hypothetical protein  23.79 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  28.7 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.58 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  24.05 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  22.63 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  30.31 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  24.88 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  26.14 
 
 		 361 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  27.52 
 
 		 324 aa  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  23.11 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  23.11 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  28.79 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  22.9 
 
 		 326 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  24.11 
 
 		 326 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.79 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  31.63 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.38 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.69 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.79 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.69 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.4 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  32.65 
 
 		 326 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  32.65 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  32.65 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  29.37 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.34 
 
 		 316 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  26.73 
 
 		 314 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  24.17 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  24.17 
 
 		 327 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.33 
 
 		 318 aa  43.1  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  23.56 
 
 		 318 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>