50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1795 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  811    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  31.34 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  28.1 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  25.93 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  27.24 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  26.72 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  24.31 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  28.38 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  29.15 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  34.06 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  27.16 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  24.6 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1207  putative hexapeptide transferase family protein  28.1 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  27.2 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  27.63 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  24.83 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28.63 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  23.74 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  26.15 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  26.82 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  32.74 
 
 		 314 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1213 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.49 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.53 
 
 		 311 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  24.81 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  26.47 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.85 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  24.81 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  26.83 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  36.26 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  36.26 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  36.26 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.13 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.83 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  27.14 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  24.8 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.16 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.16 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  32.97 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.16 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.16 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.16 
 
 		 320 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  34.07 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  34.07 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4605  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  34.07 
 
 		 314 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  31.78 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.36 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.22 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>