51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1881 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  100 
 
 
320 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  63.32 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  61.32 
 
 
322 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  63.46 
 
 
321 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  62.82 
 
 
322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.86 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.02 
 
 
318 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  61.22 
 
 
318 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  61.27 
 
 
318 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.32 
 
 
316 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.84 
 
 
314 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.49 
 
 
330 aa  378  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.17 
 
 
314 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.84 
 
 
314 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  59.03 
 
 
314 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  59.35 
 
 
314 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.84 
 
 
314 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.46 
 
 
320 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.84 
 
 
314 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.28 
 
 
320 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  57.84 
 
 
314 aa  363  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.33 
 
 
299 aa  358  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
334 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.59 
 
 
320 aa  345  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.55 
 
 
351 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.24 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  50.16 
 
 
327 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  50.16 
 
 
327 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  51.1 
 
 
328 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  50.49 
 
 
326 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  49.69 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  49.68 
 
 
326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.32 
 
 
327 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.68 
 
 
326 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  52.65 
 
 
313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.68 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.68 
 
 
326 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50.66 
 
 
311 aa  295  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  50.16 
 
 
315 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  50.16 
 
 
315 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  39.6 
 
 
324 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  39.93 
 
 
305 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  39.56 
 
 
305 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  39.93 
 
 
305 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  25.71 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  25.61 
 
 
380 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.89 
 
 
310 aa  47  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  27.63 
 
 
292 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2226  hypothetical protein  24.3 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.305387  hitchhiker  4.27073e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  24.36 
 
 
389 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>