45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2495 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  37.96 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  36.75 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  35.07 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  30.48 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  29.29 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  29.31 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  30.53 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3062  hypothetical protein  29.66 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.147706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  28.89 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0680  hypothetical protein  27.38 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  29.26 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  26.8 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  30.45 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  30.38 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  29.49 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1213 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  29.67 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  29.41 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  29.1 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.44 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  26.17 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  25.91 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.56 
 
 		 320 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  25.78 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  26.92 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  26.36 
 
 		 327 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  26.36 
 
 		 327 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.56 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2445  hypothetical protein  29.02 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.19 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.19 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.19 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.56 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.11 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  26.04 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.29 
 
 		 330 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  23.89 
 
 		 322 aa  47  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2535  hypothetical protein  23.08 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0241479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  24.9 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  25.69 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.4 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.65 
 
 		 316 aa  42.7  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>