43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1560 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  827    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  28.02 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  28.4 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  27.31 
 
 		 348 aa  90.1  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  31.42 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  29.58 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  26.22 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  25.11 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  25.98 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  23.89 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  23.55 
 
 		 434 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1207  putative hexapeptide transferase family protein  31.03 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1213 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  26.34 
 
 		 313 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  32.9 
 
 		 324 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4605  hypothetical protein  26.96 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  24 
 
 		 315 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  24 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  30.07 
 
 		 311 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2445  hypothetical protein  25.1 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  33.03 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28 
 
 		 324 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  27.65 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.37 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  27.06 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  29.71 
 
 		 305 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  22.46 
 
 		 328 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  24.48 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  24.48 
 
 		 326 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  28.97 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28.97 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  28.97 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28.97 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28.97 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  24.48 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28.97 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  28.97 
 
 		 326 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3062  hypothetical protein  25 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.147706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  31.82 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  31.82 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35958  predicted protein  25.88 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  27.78 
 
 		 321 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  29.09 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>