54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2076 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  100 
 
 		 329 aa  672    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  89.47 
 
 		 326 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  89.16 
 
 		 326 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  89.78 
 
 		 326 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  89.16 
 
 		 328 aa  591  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  88.82 
 
 		 327 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  88.82 
 
 		 327 aa  591  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  88.54 
 
 		 327 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  86.07 
 
 		 326 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  85.45 
 
 		 326 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  85.23 
 
 		 328 aa  572  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.28 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  53.77 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  53.77 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  51.58 
 
 		 311 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.04 
 
 		 351 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  52.08 
 
 		 313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.37 
 
 		 320 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  47.66 
 
 		 322 aa  308  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  46.73 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  48.11 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  47.8 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  47.04 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  49.52 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  47.44 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.35 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.28 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  51.74 
 
 		 318 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.56 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.24 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.33 
 
 		 320 aa  291  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.24 
 
 		 314 aa  291  8e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.66 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.32 
 
 		 314 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.02 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.02 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.53 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.69 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  45.54 
 
 		 320 aa  279  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  43.85 
 
 		 316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  41.04 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  41.76 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  41.03 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  41.03 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  26.14 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  23.88 
 
 		 597 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  23.76 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  23.39 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  24.56 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  24.15 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  27.82 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  23.4 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  24.4 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>