66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0729 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  680    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  84.64 
 
 		 322 aa  567  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  85.17 
 
 		 322 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  79.62 
 
 		 321 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  63.32 
 
 		 320 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  64.24 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  63.69 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  63.11 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  62.78 
 
 		 314 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.86 
 
 		 318 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  62.46 
 
 		 314 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.78 
 
 		 316 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.9 
 
 		 318 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.88 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.88 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.57 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.57 
 
 		 314 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.58 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  58.79 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.83 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  59.22 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  55.85 
 
 		 299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  57.29 
 
 		 334 aa  352  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.17 
 
 		 320 aa  347  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.28 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.96 
 
 		 324 aa  318  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  48.93 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  51.5 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  49.2 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  50.17 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.8 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  47.59 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  47.59 
 
 		 327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.91 
 
 		 327 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.94 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.62 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.94 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  47.63 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  47.3 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  46.58 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  46.58 
 
 		 315 aa  276  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  40.57 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  38.95 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  41.28 
 
 		 305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  40.21 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  26.27 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  23.25 
 
 		 597 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.85 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  29.69 
 
 		 390 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  31.78 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.37 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  23.37 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  23.37 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 		 593 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  23.37 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  25.33 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  24.55 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  24.55 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  24.55 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  24.55 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  24.55 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  25.5 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.14 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  25.74 
 
 		 584 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  24.55 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>