61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2044 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  100 
 
 
299 aa  614  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  59.8 
 
 
314 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57.24 
 
 
320 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  58.33 
 
 
320 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  55.48 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  55.85 
 
 
329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  55.15 
 
 
322 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  53.85 
 
 
321 aa  345  7e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.88 
 
 
318 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  53.87 
 
 
318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  54.88 
 
 
318 aa  341  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.55 
 
 
314 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.55 
 
 
314 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  54.33 
 
 
334 aa  339  4e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.55 
 
 
314 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.02 
 
 
320 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.73 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.21 
 
 
318 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.54 
 
 
314 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.05 
 
 
314 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.05 
 
 
314 aa  332  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.99 
 
 
330 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.68 
 
 
320 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.84 
 
 
316 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.43 
 
 
324 aa  305  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.33 
 
 
351 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.53 
 
 
329 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  46.05 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  47.77 
 
 
313 aa  276  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  45.21 
 
 
326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  47.57 
 
 
311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  46.38 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  45.54 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.29 
 
 
326 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.29 
 
 
326 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.29 
 
 
326 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  44.08 
 
 
327 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  44.08 
 
 
327 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.93 
 
 
327 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  44 
 
 
315 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  43.67 
 
 
315 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  37.28 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  39.13 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  38.41 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  38.41 
 
 
305 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 
609 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  26.13 
 
 
389 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
594 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
594 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
594 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  23.94 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  30.23 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  28.41 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  26.57 
 
 
584 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  23.15 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  23.4 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 
593 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  21.61 
 
 
375 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  41.27 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  29.17 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  26.71 
 
 
380 aa  42.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>