47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2085 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  100 
 
 		 318 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  81.85 
 
 		 316 aa  544  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  79.55 
 
 		 314 aa  527  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  81.15 
 
 		 314 aa  527  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  81.47 
 
 		 314 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  79.23 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  80.57 
 
 		 318 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  79.23 
 
 		 314 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  81.15 
 
 		 314 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  79.23 
 
 		 314 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  80.25 
 
 		 318 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  80.39 
 
 		 320 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  81.03 
 
 		 320 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  79.11 
 
 		 318 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  63.46 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  62.66 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  61.86 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  61.86 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  60.9 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  56.59 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  54.84 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.8 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.88 
 
 		 299 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.88 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.16 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50.33 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  50.99 
 
 		 313 aa  315  7e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.36 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  46.58 
 
 		 328 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  45.6 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  45.89 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  45.82 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  47.32 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  47.32 
 
 		 327 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  45.65 
 
 		 326 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  45.65 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  45.65 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.69 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  45.74 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  48.54 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  48.54 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  37.01 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  37.55 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  37.18 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  36.01 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  35.16 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  25.33 
 
 		 428 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>