66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003932 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  95.03 
 
 		 322 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  100 
 
 		 322 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  85.17 
 
 		 329 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  81.13 
 
 		 321 aa  532  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  65.81 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  63.32 
 
 		 318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  62.82 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  62.66 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  62.26 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.8 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  63.11 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.86 
 
 		 316 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  62.78 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  62.46 
 
 		 314 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.26 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.26 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.26 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.39 
 
 		 330 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.95 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  60.26 
 
 		 314 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  59.49 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  55.49 
 
 		 334 aa  358  6e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  55.15 
 
 		 299 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.21 
 
 		 320 aa  346  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.16 
 
 		 351 aa  322  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.15 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  48.77 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  47.98 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  48.68 
 
 		 313 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.35 
 
 		 327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.38 
 
 		 326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.04 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.38 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.08 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  46.95 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  46.95 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  46.3 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  45.99 
 
 		 326 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  46.58 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  46.58 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  39.5 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  38.38 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  40.21 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  39.15 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  24.83 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  25.99 
 
 		 391 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  25.33 
 
 		 390 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  23.76 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1009  ribosomal protein S6 modification protein  23.76 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1028  ribosomal protein S6 modification protein  23.76 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.275544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0912  ribosomal protein S6 modification protein  23.76 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0980  ribosomal protein S6 modification protein  23.76 
 
 		 300 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0524519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  21.48 
 
 		 597 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  24.5 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  24.42 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  30.43 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  23.89 
 
 		 380 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.43 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  23.43 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.15 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.5 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  22.76 
 
 		 434 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2213  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.66 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2583  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.66 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.549073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  28.68 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>