48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2581 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  100 
 
 		 320 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  89.34 
 
 		 320 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  82.17 
 
 		 316 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  81.03 
 
 		 318 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  79.18 
 
 		 318 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  78.91 
 
 		 314 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  77.81 
 
 		 314 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  77.81 
 
 		 314 aa  507  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  79.42 
 
 		 314 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  78.91 
 
 		 314 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  77.49 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  77.17 
 
 		 314 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  77.14 
 
 		 318 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  76.43 
 
 		 318 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  61.59 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  60.95 
 
 		 322 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  58.79 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  57.46 
 
 		 320 aa  371  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  58.54 
 
 		 321 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  56.03 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  56.54 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.75 
 
 		 320 aa  341  9e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.02 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.68 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.19 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.86 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  49.17 
 
 		 313 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  47.84 
 
 		 311 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.96 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  46.65 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.65 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  46.65 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  47.59 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.65 
 
 		 326 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.33 
 
 		 329 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  46.33 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  46.96 
 
 		 328 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  44.87 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  44.87 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  48.05 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  48.05 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  35.59 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  35.94 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  35.29 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  35.59 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  27.14 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  23.39 
 
 		 390 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  25.55 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>