59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3346 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 334 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.84 
 
 		 318 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  56.54 
 
 		 320 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  56.09 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  55.49 
 
 		 322 aa  358  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  55.35 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  57.65 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  55.77 
 
 		 318 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  55.84 
 
 		 318 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  57.29 
 
 		 329 aa  352  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  53.97 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.07 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  55.95 
 
 		 320 aa  348  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.58 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.55 
 
 		 314 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.22 
 
 		 314 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  56.15 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.27 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.9 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.27 
 
 		 314 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.27 
 
 		 314 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.95 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.33 
 
 		 299 aa  339  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.94 
 
 		 330 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.93 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  49.83 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  49.83 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50 
 
 		 311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.53 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.44 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  46.5 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  46.15 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  46.15 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.94 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.24 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.24 
 
 		 326 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.24 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  47.89 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  43.83 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  43.83 
 
 		 315 aa  274  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  40.21 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  39.86 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  38.36 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  39.1 
 
 		 324 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  24.15 
 
 		 310 aa  49.3  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  24.8 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  27.1 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  23.31 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  24.47 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1168  YheD  23.9 
 
 		 445 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  26.24 
 
 		 391 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0012  alpha-L-glutamate ligase  24.58 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02450  Glutathione synthase  28.7 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  24.15 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  29.2 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4402  hypothetical protein  21.29 
 
 		 328 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.251004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.73 
 
 		 459 aa  42.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  22.88 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>