46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1168 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1168  YheD  100 
 
 
445 aa  907    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1480  hypothetical protein  35 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0764  hypothetical protein  34.29 
 
 
486 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.901113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0950  hypothetical protein  30.38 
 
 
486 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.632241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0758  hypothetical protein  31.7 
 
 
486 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0952  hypothetical protein  31.45 
 
 
486 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0765  hypothetical protein  31.45 
 
 
486 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00044561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0817  hypothetical protein  32.02 
 
 
486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0860  hypothetical protein  32.02 
 
 
486 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0892459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1040  hypothetical protein  30.16 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4425  hypothetical protein  32.11 
 
 
485 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0706198  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0913  hypothetical protein  31.85 
 
 
485 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0692  hypothetical protein  31.77 
 
 
477 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1429  hypothetical protein  27.48 
 
 
449 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0626  hypothetical protein  28.53 
 
 
449 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1174  hypothetical protein  33.88 
 
 
368 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0628  RimK domain protein ATP-grasp  30.64 
 
 
362 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000491808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1431  hypothetical protein  31.42 
 
 
358 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1482  hypothetical protein  27.73 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2930  hypothetical protein  29.44 
 
 
919 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.285425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1577  hypothetical protein  27.69 
 
 
464 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29001e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0627  hypothetical protein  27.54 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0638455  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1430  hypothetical protein  27.91 
 
 
355 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1165  hypothetical protein  29.14 
 
 
280 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0961  Glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)-like protein  27.37 
 
 
460 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000536628  normal  0.252832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0625  hypothetical protein  27.53 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0326  hypothetical protein  26.59 
 
 
932 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.286985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2226  hypothetical protein  26.19 
 
 
457 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.305387  hitchhiker  4.27073e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0695  hypothetical protein  27.76 
 
 
390 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1167  hypothetical protein  32.96 
 
 
186 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1576  hypothetical protein  25.15 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16017e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0914  hypothetical protein  24.1 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000538183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4424  hypothetical protein  24.11 
 
 
350 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340963  normal  0.453789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1041  hypothetical protein  24.1 
 
 
350 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000256007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0766  hypothetical protein  23.75 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000135958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0951  hypothetical protein  23.88 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.011696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0759  hypothetical protein  23.58 
 
 
350 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.158938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0861  hypothetical protein  23.46 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000150421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0953  hypothetical protein  23.46 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1428  hypothetical protein  27.33 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0818  hypothetical protein  23.46 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0492826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1479  hypothetical protein  26.64 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.607602  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2062  hypothetical protein  25.81 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0765  hypothetical protein  21.3 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0960  hypothetical protein  23.79 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00168179  normal  0.245965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  23.9 
 
 
334 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>