58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1131 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  799    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  67 
 
 
390 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  27.24 
 
 
389 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  29.79 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  24.79 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  28.23 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  28.51 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  27.11 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  28.43 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  28.45 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  26.75 
 
 
326 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  26.75 
 
 
326 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.45 
 
 
324 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.14 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  29.22 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  26.94 
 
 
320 aa  58.2  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.78 
 
 
327 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.36 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.17 
 
 
318 aa  57  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  28.4 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  28.4 
 
 
315 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  27.6 
 
 
326 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.83 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  26.73 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  27 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  26.73 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  27.12 
 
 
311 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  23.58 
 
 
321 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  23.77 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.55 
 
 
318 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  28.66 
 
 
1213 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  26.79 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  23.77 
 
 
327 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2535  hypothetical protein  25.91 
 
 
348 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0241479 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  24.18 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  24.05 
 
 
318 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  29.46 
 
 
313 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.28 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  26.24 
 
 
334 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.14 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  25.79 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  27.84 
 
 
299 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.14 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.7 
 
 
316 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  32.26 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.25 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  22.63 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.25 
 
 
314 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1207  putative hexapeptide transferase family protein  25 
 
 
370 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  26.1 
 
 
314 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.99 
 
 
320 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  25.88 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.71 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  26.96 
 
 
320 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.69 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0680  hypothetical protein  24.85 
 
 
439 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.67 
 
 
318 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>