55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3414 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  594  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  94.75 
 
 
305 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  94.43 
 
 
305 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  80.87 
 
 
324 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  43.42 
 
 
311 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  39.15 
 
 
318 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  41.39 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  41.39 
 
 
326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  41.39 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  42.49 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  41.39 
 
 
326 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  41.03 
 
 
329 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  39.5 
 
 
318 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  40.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  40.66 
 
 
327 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  42.6 
 
 
324 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  41.03 
 
 
326 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  39.93 
 
 
328 aa  215  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  41.03 
 
 
326 aa  215  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  42.7 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.57 
 
 
318 aa  211  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.58 
 
 
314 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.58 
 
 
314 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  40.57 
 
 
329 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.79 
 
 
314 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  38.36 
 
 
334 aa  208  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.43 
 
 
314 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.24 
 
 
314 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  38.63 
 
 
314 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  39.5 
 
 
322 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.72 
 
 
314 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.72 
 
 
314 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  39.15 
 
 
322 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  40.22 
 
 
315 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  40.22 
 
 
315 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  40.64 
 
 
320 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  39.93 
 
 
320 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  38.43 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  40.14 
 
 
351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.01 
 
 
318 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.23 
 
 
316 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  35.59 
 
 
320 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  39.13 
 
 
299 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  38.95 
 
 
330 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  36.3 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  31.3 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  26.17 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  26.15 
 
 
389 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  27.67 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  28.75 
 
 
390 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  27.27 
 
 
434 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  27.51 
 
 
440 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  29.52 
 
 
400 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  29.37 
 
 
428 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  25.1 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>