49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2431 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  100 
 
 		 351 aa  716    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  61.25 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.19 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.67 
 
 		 326 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.67 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.67 
 
 		 326 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  52.55 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.35 
 
 		 327 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  56.89 
 
 		 311 aa  329  3e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  50.63 
 
 		 322 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  51.75 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.33 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  52.5 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  53.05 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  54 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  53.58 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  50.16 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.16 
 
 		 318 aa  322  7e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  50.16 
 
 		 327 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  50.16 
 
 		 327 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.19 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  48.28 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  51.19 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  48.44 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  53.33 
 
 		 326 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50.51 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.05 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.05 
 
 		 314 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.78 
 
 		 318 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.22 
 
 		 314 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.94 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  51.93 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.94 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.6 
 
 		 314 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.68 
 
 		 320 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.19 
 
 		 314 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  54.06 
 
 		 313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  49.36 
 
 		 315 aa  302  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  49.36 
 
 		 315 aa  301  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.33 
 
 		 299 aa  297  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  40.32 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  40.14 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  40.49 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  40.14 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  27.19 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  26.77 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  23.83 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  36.07 
 
 		 375 aa  42.7  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>