43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1940 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  769    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  26.11 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  30.18 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  25.97 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  25.23 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  22.22 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  25.63 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  27.34 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  24.37 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  23.74 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  26.17 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  25.1 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  24.32 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  25.68 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  24.05 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  24.45 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3062  hypothetical protein  28.41 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.147706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1207  putative hexapeptide transferase family protein  23.77 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  23.57 
 
 		 326 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  26.36 
 
 		 315 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  24.61 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  25.28 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  25.91 
 
 		 315 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  23.21 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.76 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  23.02 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.86 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0680  hypothetical protein  29.33 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.51 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.16 
 
 		 327 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  21.45 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  22.46 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.16 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  27.1 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  21.94 
 
 		 327 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  21.94 
 
 		 327 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4605  hypothetical protein  19.69 
 
 		 361 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.372172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2535  hypothetical protein  29.33 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0241479 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  37.14 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  40.68 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1213 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  21.61 
 
 		 299 aa  43.1  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  36.07 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>