58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1071 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  628  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  67.42 
 
 		 311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  57 
 
 		 324 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  53.7 
 
 		 314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  52.2 
 
 		 328 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  53.55 
 
 		 328 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.6 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  50.64 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  50.64 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.08 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  56.25 
 
 		 315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.61 
 
 		 326 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.61 
 
 		 326 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  56.25 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.29 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1849  alpha-L-glutamate ligase-related protein  52.94 
 
 		 318 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2081  hypothetical protein  53.26 
 
 		 326 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0353521  hitchhiker  0.00420798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.47 
 
 		 314 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.47 
 
 		 314 aa  321  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2283  hypothetical protein  53.47 
 
 		 326 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2429  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.81 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.381621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2313  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.81 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3346  ketopantoate hydroxymethyltransferase  50 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0113741  hitchhiker  0.0076902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2085  alpha-L-glutamate ligase-like protein  50.99 
 
 		 318 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.944791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.61 
 
 		 314 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.29 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  52.65 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1881  hypothetical protein  50.17 
 
 		 321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.786267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1893  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  50 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0204076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  51.29 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2431  alpha-L-glutamate ligase-like protein  54.06 
 
 		 351 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1881  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  52.65 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0729  hypothetical protein  50.17 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2190  alpha-L-glutamate ligase-like protein  48.69 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01591  hypothetical protein  48.68 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003932  glutathione synthase/Ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  48.68 
 
 		 322 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.17 
 
 		 316 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2581  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.17 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00636314  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2024  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.83 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0769  alpha-L-glutamate ligase-like protein  49.83 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2044  alpha-L-glutamate ligase-like protein  47.77 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  42.81 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  43.77 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  42.7 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  43.06 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  24.37 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  25.33 
 
 		 400 aa  53.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  26.47 
 
 		 389 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  26.54 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  24.88 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  24.8 
 
 		 440 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  29.46 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  23.83 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  27.34 
 
 		 584 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1832  alpha-L-glutamate ligase  25.28 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2167  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.28 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.538668  normal  0.206065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0692  hypothetical protein  23.33 
 
 		 477 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.9 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>