42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0424 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0424  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  908    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2008  hypothetical protein  73.15 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0417  hypothetical protein  66.82 
 
 
434 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2495  hypothetical protein  35.45 
 
 
380 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5050  hypothetical protein  31.5 
 
 
1213 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3062  hypothetical protein  24.51 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.147706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3276  hypothetical protein  29.15 
 
 
390 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3475  hypothetical protein  29.69 
 
 
324 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  0.059667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0680  hypothetical protein  24.18 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1560  hypothetical protein  23.89 
 
 
400 aa  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1795  hypothetical protein  34.06 
 
 
389 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2534  hypothetical protein  27.27 
 
 
389 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.1398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1131  hypothetical protein  27.75 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2746  hypothetical protein  25.97 
 
 
348 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1084  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  25.84 
 
 
311 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0758785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3495  protein of unknown function DUF201  27.76 
 
 
305 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3563  protein of unknown function DUF201  27.31 
 
 
305 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41730  hypothetical protein  24.91 
 
 
327 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3541  hypothetical protein  24.91 
 
 
327 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1071  hypothetical protein  24.8 
 
 
313 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3414  hypothetical protein  27.51 
 
 
305 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323123  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1940  hypothetical protein  21.45 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0616  hypothetical protein  26.92 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.460845  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23170  hypothetical protein  24.91 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1760  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  23.74 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1107  Alpha-L-glutamate ligase-related protein  28.21 
 
 
314 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2076  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.15 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0820486  normal  0.0546773 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2270  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.05 
 
 
320 aa  47  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2330  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.15 
 
 
326 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  hitchhiker  0.000045925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3440  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.15 
 
 
326 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0617285  normal  0.0425815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0049  hypothetical protein  22.05 
 
 
412 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1931  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.15 
 
 
326 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000763274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2937  alpha-L-glutamate ligase-like protein  29.82 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.549026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1947  alpha-L-glutamate ligase-like protein  24.65 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1892  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.94 
 
 
314 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.958172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2034  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.36 
 
 
314 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.278167  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1771  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.05 
 
 
327 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  hitchhiker  0.00000210245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2372  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.22 
 
 
316 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0773331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2086  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.47 
 
 
314 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.420633  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0097  hypothetical protein  21.7 
 
 
315 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0082  hypothetical protein  21.7 
 
 
315 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2032  alpha-L-glutamate ligase-like protein  23.56 
 
 
314 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>